主要从事基层政治与乡村治理研究，是国内最早将实证研究方法引入政治学研究领域的学者之一，并从社会的角度研究政治发展过程，也是我国农村村民自治和城市社区自治研究领域的带头人之一。2006年11月30日，徐勇教授走进中南海，在中共中央政治局进行的第36次集体学习会上，作了关于中国社会主义基层民主政治建设研究的讲解。
著作
《非均衡的中国政治：城市与乡村比较》，中国广播电视出版社，1992年。
《中国农村村民自治》，华中师范大学出版社，1997年。
《乡村治理与中国政治》，中国社会科学出版社2003年。
合著：《中国城市社区自治》，武汉出版社，2002年。
合著：《流动中的乡村治理》，中国社会科学出版社，2003年。
《地方政府学》，高教出版社2005年版
论文
《中国民主之路：从形式到实体》，《开放时代》2000年第5期。
《草根民主的崛起：价值与限度》，《中国社会科学季刊》2000年夏季号。
《权力重组：能人权威的崛起和转换——广东省万丰村先行一步的放权改革及启示》，《政治学研究》1999年第1期。
《民主化进程中的政府主动性——四川省达州市村民自治示范活动调查与启示》， 《战略与管理》1997年第3期。
《村干部的双重角色：代理人与当家人》，《二十一世纪》1997年第8期。
《GOVERNANCE：治理的阐释》，《政治学研究》1997年第1期。
《农民流动、SARS与公民保障网络》，《福建师范大学学报》2003年05期
《现代国家建构中的非均衡性和自主性分析》，《华中师大学报》2003年05期
《村民自治：中国宪政制度的创新》，《中共党史研究》 2003年01期
《乡级政府为派出机构》，《决策咨询》 2003年05期
《从新权威主义到新民本主义》，《决策咨询》2003年9期
《内核-边层：可控的放权式改》，《开放时代》2003年01期
《对阶级划分的冷思考》，《探索与争鸣》2003年01期
《乡村治理结构改革的走向——强村、精乡、简县》，《战略与管理》2003年04期
《以村民自治促进人口管理》，《人口与计划生育》2003年11期
《走向新民本主义——中国改革发展的路向及转变》，《探索与争鸣》2003年09期
《精乡扩镇、乡派镇治：乡级治理体制的结构性改革》，《江西社会科学》2004年1期
《土地问题的实质是国家与农民的关系问题》，《探索与争鸣》2004年01期
《民主政治与社会主义政治文明建设》，《山东科技大学学报》2004年02期
《现代化视野中的“三农问题”》 ，《理论月刊》 2004年09期
《阶梯性社会与“三农”的提升》，《华中师范大学学报》2004年06期
《村民自治的成长：行政放权与社会发育——1990年代以来中国村民自治发展困境的反思》，《华中师范大学学报》2005年第2期
《农村总和改革：改革重心的转移》，《华中师范大学学报》2006年第5期
《中部农业主产区崛起的战略选择——关于构建第五增长级的思考》，《财政与发展》2005年第10期
《回归国家与现代国家的构建》《东南学术》2006年第4期
《再识农户与社会化小农的构建》，《华中师范大学学报》2006年第3期
《当前中国农村研究方法论问题的反思》《河北学刊》2006年第2期
《公民国家的构建与农村公共产品的供给》《华中师范大学学报》2006年第2期
《追寻现代国家国家足迹，记录现代学术风云——评《20世纪中国社会科学政治学卷》》，《江汉论坛》2006年第2期
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